В 1955 году окончил Ленинградскую духовную академию со степенью кандидата богословия за диссертацию на тему: «Ю. И. Венелин и его значение в деле возрождения болгар». Был оставлен в академии на преподавательской работе.
В 1956 присвоено звание доцента, а в 1972 назначен секретарем Ученого совета академии.
Стойков, Василий о. Святой Астерий Амасийский и его проповеди // Журнал Московской Патриархии. — 1969. — № 8. — С. 83-91.
Стойков, Василий о. О прославлении Бога словом и делами // Журнал Московской Патриархии. — 1969. — № 8. — С. 27-28.
Стойков Василий о. Отзыв о диссертации доцента Ленинградской духовной академии Н. А. Заболотского на тему: «Кафоличность — проблема экуменизма» // Защита диссертации доц. Н. А. Заболотского в ЛДА в 1969 г. на тему: «Кафоличность — проблема экуменизма». — Л., 1969. — С. 43-62.
Стойков, Василий о. Малоизвестное слово с именем святого Астерия Амасийского // Журнал Московской Патриархии. — 1971. — № 2. — С. 77-79.
Стойков, Василий о. Магистерский диспут епископа Астраханского Михаила. Еп. Михаил «Основы православного учения о личном спасении по Священному Писанию и святоотеческим высказываниям» // Журнал Московской Патриархии. — 1972. — № 8. — С. 26-27.
Стойков, Василий о. Святитель Иоанн Златоуст о покаянии и посте // Журнал Московской Патриархии. — 1973. — № 6. — С. 57-60.
Стойков, Василий о. Третье богословское собеседование в Финляндии // Журнал Московской Патриархии. — 1974. — № 10. — С. 59-63.
Стойков, Василий о. Первое собеседование богословов Русской Православной Церкви и Союза Евангелических Церквей в ГДР // Журнал Московской Патриархии. — 1975. — № 3. — С. 50-57.
Стойков, Василий о. Первое собеседование богословов Русской Православной Церкви и Союза Евангелических Церквей в ГДР // Журнал Московской Патриархии. — 1975. — № 4. — С. 66-68.
Стойков, Василий о. В Ленинградской митрополии. Празднование тридцатилетия Великой Победы // Журнал Московской Патриархии. — 1975. — № 8. — С. 7-8.
Стойков, Василий о. Богословское собеседование «Арнольдсхайн-VII» // Журнал Московской Патриархии. — 1976. — № 9. — С. 62-69.
Стойков, Василий о. На праздновании 100-летия освобождения Болгарии от османского ига // Журнал Московской Патриархии. — 1978. — № 2. — С. 58-59.
Стойков, Василий о. На праздновании 100-летия освобождения Болгарии от османского ига // Журнал Московской Патриархии. — 1978. — № 3. — С. 51-57.
Стойков, Василий о. Участие русского народа в освобождении Болгарии (по страницам «Церковного вестника») // Журнал Московской Патриархии. — 1978. — № 4. — С. 54-56; 1978. — № 5. — С. 44-46.
Стойков, Василий о. Хельд Хайнц-Йоахим. Тезисы по теме «Церковное служение современному миру» [IX Богословское собеседование представителей Русской Православной Церкви и Евангелической Церкви в Германии, ФРГ («Арнольдсхайн-IX»)] // Журнал Московской Патриархии. — 1982. — № 1. — С. 56.
Стойков, Василий о. Поучение на апостольское чтение (Гал. 1, 11) // Журнал Московской Патриархии. — 1989. — № 5. — С. 35-36.
Стойков, Василий о. Церковно-общественное значение трудов святителя Софрония Врачанского // Журнал Московской Патриархии. — 1989. — № 11. — С. 50-53.
Стойков, Василий о. Поучение в Неделю сыропустную // Вестник Ленинградской духовной академии. — 1990. — № 1. — С. 81-83.
Стойков, Василий о. Поучение в Неделю 29-ю // Вестник Ленинградской духовной академии. — 1990. — № 3. — С. 121—123.
Стойков, Василий о. Поучение перед новогодним молебном // Христианское чтение. — 1992. — № 7. — С. 53-55.
Стойков, Василий о. Начало юбилейных торжеств. Праздник св. ап. Иоанна Богослова и юбилеи СПбДА: 275-летие со дня основания и 50-летие со дня восстановления // Христианское чтение. — 1996. — № 13. — С. 5-9.
Стойков, Василий о. Венец юбилея. О юбил. торжествах в СПбДА в дек. 1996 г. // Христианское чтение. — 1997. — № 14. — С. 5-10.
Стойков, Василий о. Из летописи духовных школ в Санкт-Петербурге: (Исторические вехи). Докл. на юбил. конф. СПбДАиС. 25-26 дек. 1996 г. // Христианское чтение. — 1997. — № 14. — С. 28-42.
Стойков, Василий о.; Тельпис Г. о. Отчет о состоянии СПбДАиС за 1997/98 учебный год // Христианское чтение. — 1999. — № 17. — С. 5-20.
Стойков, Василий о.Н. А. Заболотский; + 4 янв. 1999 г. Некролог // Христианское чтение. — 1999. — № 17. — С. 184—188
Стойков, Василий о. Актовая речь, посвященная памяти заслуженного профессора СПбДА Н. Д. Успенского (к 100-летию со дня рождения) // Христианское чтение. — 2000. — № 19. — С. 21-38.